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Editor-in-Chief: Nauck, Matthias

Editorial Board Member: Fraunberger, Peter / Klein, Hanns-Georg / Klouche, Mariam / Kohse, Klaus P. / Luppa, Peter B. / März, Winfried / Nebe, Carl Thomas / Orth, Matthias / Ruf, Andreas / Schuff-Werner, Peter / Steimer, Werner / Stieber, Petra / Wallaschofski, Henri / Weber, Bernard / Wieland, Eberhard / Sack, Ulrich

6 Issues per year

Increased IMPACT FACTOR 2013: 0.299



How valid is single nucleotide polymorphism (SNP) diagnosis for the individual risk assessment of breast cancer? / Welchen Stellenwert hat der diagnostische Einsatz von Einzelnukleotid-Polymorphismen (SNPs) bei der individuellen Risikoeinschätzung von Brustkrebs?

Clemens B. Tempfer1 / Lukas A. Hefler2 / Christian Schneeberger3 / Johannes C. Huber4





Correspondence: Clemens Tempfer, MD, Department of Obstetrics and Gynecology, University of Vienna Medical School, Waehringer Guertel 18-20, 1090 Vienna, Austria Tel.: +43 1 40400 2813 Fax: +43 1 40400 2911

Citation Information: LaboratoriumsMedizin. Volume 30, Issue 3, Pages 160–164, ISSN (Online) 0025-8466, ISSN (Print) 0342-3026, DOI: 10.1515/JLM.2006.023, July 2006

Publication History

Published Online:


The number of reports investigating disease susceptibility based on the carriage of low-penetrance, high-frequency single nucleotide polymorphisms (SNPs) has increased over the last years. Evidence is accumulating defining specific individual variations in breast cancer susceptibility. Genetic variations of the estradiol and xenobiotic metabolisms, as well as genes involved in cell cycle control, have been described as significant contributors to breast cancer susceptibility with variations depending on ethnic background and co-factors such as smoking and family history of breast cancer. In sum, the highest level of evidence to date linking SNPs and breast cancer comes from nested case-control studies within the prospective Nurses' Health Study. These data establish seven SNPs – hPRB +331 G/A, AR CAG repeat, CYP 19 TTTA(10), CYP 1A1 Msp I, VDR FOK1, XRCC1 Arg194Trp, and XRCC2 Arg188His – as small, but significant risk factors for spontaneous, non-hereditary breast cancer. In addition, meta-analysis of data in the literature established the TGFBR1*6A, the HRAS1, GSTP Ile105Val, and the GSTM1 SNPs as low-penetrance genetic risk factors for sporadic breast cancer. The clinical consequences of such a risk elevation may be a detailed instruction of the patient as to general measures of breast cancer prevention such as a low-fat diet, optimization of the BMI, physical exercise, avoidance of alcohol and long-term hormone replacement therapy (HRT), and participation in a breast cancer screening program between the age of 50 and 70 years. Specific surgical or drug interventions such as prophylactic mastectomy and oophorectomy or prophylactic intake of tamoxifen are not indicated based on SNP analysis at this time.


In den letzten Jahren gab es viele Forschungsberichte über die Krankheitsempfänglichkeit der Träger von Einzelnukleotid-Polymorphismen (SNPs) mit niedriger Penetranz und hoher Häufigkeit. Es gibt zunehmende Evidenz für die Bedeutung spezifischer individueller Variationen für die Empfänglichkeit für Brustkrebs. Genetische Variationen im Stoffwechsel von Estradiol und Xenobiotika wie auch in Genen, die den Zellzyklus kontrollieren, wurden als signifikante beitragende Faktoren zur Brustkrebsempfänglichkeit beschrieben, allerdings in Abhängigkeit von ethnischem Hintergrund und Kofaktoren wie Rauchen und Familiengeschichte für Brustkrebs. Die stärkste Evidenz für den Zusammenhang von bestimmten SNPs und Brustkrebsrisiko kommt aus nested Fall-Kontroll-Analysen der prospektiven Nurses' Health Studie. Diese Daten identifizierten sieben SNPs – hPRB +331 G/A, AR CAG repeat, CYP 19 TTTA(10), CYP 1A1 Msp I, VDR FOK1, XRCC1 Arg194Trp, und XRCC2 Arg188His – als geringfügige aber signifikante Risikofaktoren für sontanen, nicht-erblichen Brustkrebs. Darüberhinaus haben Meta-Analysen die SNPs TGFBR1*6A, HRAS1, GSTP Ile105Val, und GSTM1 SNPs als genetische Risikofaktoren mit niedriger Penetranz für sporadischen Brustkrebs dokumentiert. Die klinischen Konsequenzen dieser Risikoerhöhung sind die detaillierte Aufklärung der Patientinnen über allgemeine Präventionsmassnahmen wie Ernährung mit niedrigem Fettgehalt, Optimierung des BMI, körperliche Aktivität, Vermeidung von Alkohol und Hormonersatztherapie sowie die Teilnahme an Brustkrebs-Screening-Programmen im Alter zwischen 50 und 70 Jahren. Spezifische chirurgische oder pharmakologische Interventionen wie prophylaktische Mastektomie, Oophorektomie oder Einnahme von Tamoxifen sind derzeit nicht auf der Basis von SNP Analysen indiziert.

Keywords: breast cancer; polymorphism; risk assessment; susceptibility; Brustkrebs; Polymorphismen; Risikoabschätzung; Empfänglichkeit

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