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it - Information Technology

Methods and Applications of Informatics and Information Technology

Editor-in-Chief: Conrad, Stefan / Molitor, Paul

6 Issues per year

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ISSN
2196-7032
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Volume 53, Issue 5

Issues

Informatics and Translational Medical Research: Challenges and Developments

Fabian Prasser / Sebastian H. R. Wurst / Gregor Lamla / Florian Kohlmayer / Rainer Blaser / Dominik Schmelcher / Bernd Vögele / Klaus A. Kuhn
Published Online: 2011-09-20 | DOI: https://doi.org/10.1524/itit.2011.0646

Abstract

This article gives an overview of informatics challenges arising in the context of translational medical research. This research concept, which has developed during the last years, aims at transferring scientific knowledge from foundational (“bench”) to clinical research and further to clinical and medical practice (“bedside”). The reverse direction is also important: clinical data are needed for feedback and as stimuli for the generation of research hypotheses. To achieve this, collaboration is needed between separate domains with differing “cultures”, regulations and IT requirements. From the informatics perspective, novel and unique questions arise. While the scientific areas involved, biochemistry, molecular biology, medicine, statistics, epidemiology, and others, have been using informatics methods for many years, their concepts differ and communication is restricted. We will summarize the challenges in this rapidly evolving domain and present recent developments, focusing on integration architectures and concepts, on security and privacy, and on software engineering.

In dieser Arbeit werden Herausforderungen für die Informatik bei der Unterstützung der translationalen Forschung in der Medizin dargestellt. Dieses Forschungskonzept, welches in den letzten Jahren entstanden ist, zielt darauf ab, wissenschaftliche Erkenntnisse aus der biomedizinischen Grundlagenforschung (“bench”) in klinische Forschung und von dort in die Krankenversorgung (“bedside”) zu übertragen. In umgekehrter Richtung dienen klinische Daten als Ausgangspunkt für die Generierung neuer Forschungshypothesen. Dies erfordert eine Kollaboration zwischen traditionell getrennten Wissenschaftsbereichen, mit ihren eigenen, oft widersprüchlichen “Kulturen”, Regularien und IT-Anforderungen. Aus dem Blickwinkel der Informatik ergeben sich hierbei neuartige Fragestellungen. Obwohl in den beteiligten Wissenschaftsbereichen, wie Biochemie, Molekularbiologie, Medizin, Statistik, Epidemiologie und anderen seit vielen Jahren Methoden der Informatik Verwendung finden, unterscheiden sich deren Konzepte. Ein Austausch findet nur in sehr eingeschränktem Maße statt. Dieser Artikel fasst die Herausforderungen in dieser sich rasch wandelnden Domäne zusammen und stellt aktuelle Entwicklungen vor, insbesondere in den Bereichen Integrationsarchitekturen und -konzepte, IT Sicherheit und Datenschutz, sowie Software Engineering.

Keywords: software architectures; domain-specific architectures; database management; database applications; information systems

About the article

* Correspondence address: TU München, Institut für Medizinische Statistik und Epidemolog, Ismaninger Str. 22, 81675 München, Deutschland,


Published Online: 2011-09-20

Published in Print: 2011-09-01


Citation Information: it - Information Technology Methoden und innovative Anwendungen der Informatik und Informationstechnik, Volume 53, Issue 5, Pages 217–226, ISSN (Print) 1611-2776, DOI: https://doi.org/10.1524/itit.2011.0646.

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