Jump to ContentJump to Main Navigation
Show Summary Details
In This Section

Journal of Apicultural Science

The Journal of Research Institute of Horticulture and Apicultural Research Association

2 Issues per year


IMPACT FACTOR 2016: 0.722
5-year IMPACT FACTOR: 0.944

CiteScore 2016: 0.84

SCImago Journal Rank (SJR) 2015: 0.392
Source Normalized Impact per Paper (SNIP) 2015: 0.470

Open Access
Online
ISSN
2299-4831
See all formats and pricing
In This Section

Single Assay Detection of Acute Bee Paralysis Virus, Kashmir Bee Virus and Israeli Acute Paralysis Virus

Roy Francis
  • Department of Integrated Pest Management, Aarhus University, Forsøgsvej 1, 4200 Slagelse, Denmark
/ Per Kryger
  • Department of Integrated Pest Management, Aarhus University, Forsøgsvej 1, 4200 Slagelse, Denmark
Published Online: 2012-06-19 | DOI: https://doi.org/10.2478/v10289-012-0014-x

Single Assay Detection of Acute Bee Paralysis Virus, Kashmir Bee Virus and Israeli Acute Paralysis Virus

A new RT-PCR primer pair designed to identify Acute Bee Paralysis Virus (ABPV), Kashmir Bee Virus (KBV) or Israeli Acute Bee Paralysis Virus (IAPV) of honey bees (Apis mellifera L.) in a single assay is described. These primers are used to screen samples for ABPV, KBV, or IAPV in a single RT-PCR reaction saving time and money. The primers are located in the predicted overlapping gene (pog/ORFX) which is highly conserved across ABPV, KBV, IAPV and other dicistroviruses of social insects. This study has also identified the first case of IAPV in Denmark.

Jednoczesne Wykrywanie Wirusa Ostrego Paraliżu Pszczół, Kaszmirskiego Wirusa Pszczół i Izraelskiego Wirusa Ostrego Paraliżu Pszczół

Badanie pszczół na obecność wirusów jest zarówno czasochłonne, jak i drogie. Siedem wirusów, które są obecnie są najczęściej badane u pszczół, przy konwencjonalnym PCR wymagają przeprowadzenia oddzielnych analiz dla każdego z oznaczanych wirusów w badanej próbie. W pracy prezentowane jest wykorzystanie starterów AKI, przy pomocy których w pojedynczej reakcji można wykryć obecność każdego z trzech wirusów: wirus ostrego paraliżu pszczół (ABPV), wirus kaszmirski (KBV), izraelski wirus ostrego paraliżu (IAPV). Analiza sekwencji genów z GenBank wykazała, że wirusy te są ze sobą ściśle spokrewnione. W sekwencji wszystkich 3 wirusów został zidentyfikowany specyficzny region o 100% podobieństwie i opracowano startery, które pozwalają na powielenie tego regionu. Nowe startery zostały sprawdzone na 87 próbach. Jednocześnie wszystkie te próby zostały przebadane przy użyciu wcześniej stosowanych starterów, specyficznych dla każdego z wirusów. Stwierdzono, że we wszystkich przypadkach gdzie z użyciem specyficznego startera uzyskano produkt, ten sam produkt był również otrzymywany przy zastosowaniu starterów AKI. Uzyskane produkty AKI PCR zawierają tylko 101 par zasad, dzięki czemu są wystarczająco długie do wykrycia na żelu, ale na tyle krótkie, aby można je analizować za pomocą Real Time PCR.

Podczas badań, po raz pierwszy stwierdzono występowanie IAPV w Danii, co zostało potwierdzone poprzez sekwencjonowanie i otrzymanie specyficznego produktu z użyciem innych starterów.

Keywords: honey bee virus; IAPV; KBV; ABPV; AKI primers

Keywords: wirusy pszczoły miodnej; IAPV; KBV; ABPV; startery AKI

  • Altschul S. F., Gish W., Miller W., Myers E. W., Lipman D. J. (1990) - Basic local alignment search tool. J. Mol. Biol., 215 (3): 403-410.

  • Chen Y. P., Siede R. (2007) - Honey bee viruses. Adv. Virus Res., 70: 33-80. [Web of Science]

  • Cox-Foster D. L., Conlan S., Holmes E. C., Palacios G., Evans J. D., Moran N. A., Quan P. L., Briese T., Hornig M., Geiser D. M., Martinson V., Vanengelsdorp D., Kalkstein A. L., Drysdale A., Hui J., Zhai J. H., Cui L. W., Hutchison S. K., Simons J. F., Egholm M., Pettis J. S., Lipkin W. I. (2007) - A metagenomic survey of microbes in honey bee colony collapse disorder. Science, 318: 283-287. [Web of Science]

  • De Miranda J. R., Cordoni G., Budge G. (2010) - The Acute bee paralysis virus-Kashmir bee virus-Israeli acute paralysis virus complex. J. Invert. Pathol., 103: 30-47. [Web of Science]

  • Drummond A. J., Ashton B., Buxton S., Cheung M., Cooper A., Duran C., Field M., Heled J., Kearse M., Markowitz S., Moir R., Stones-Havas S., Sturrock S., Thierer T., Wilson A. (2011) - Geneious v5.4, [online: http://www.geneious.com/

  • Firth A. E., Wang Q. S., Jan E., Atkins J. F. (2009) - Bioinformatic evidence for a stem-loop structure 5 '-adjacent to the IGR-IRES and for an overlapping gene in the bee paralysis dicistroviruses. Virology Journal, 6. [Web of Science] [PubMed]

  • Grabensteiner E., Bakonyi T., Ritter W., Pechhacker H., Nowotny N. (2007) - Development of a multiplex RT-PCR for the simultaneous detection of three viruses of the honeybee (Apis mellifera L.): Acute bee paralysis virus, Black queen cell virus and Sacbrood virus. J. Invert. Pathol., 94(3): 222-225. [PubMed]

  • Grabensteiner E., Ritter A., Carter M. J., Davison S., Pechhacker H., Kolodziejek J., Boecking O., Derakhshifar I., Moosbeckhofer R., Licek E., Nowotny R. (2001) - Sacbrood virus of the honeybee (Apis mellifera): Rapid identification and phylogenetic analysis using reverse transcription-PCR. Clin. Diagn. Lab. Immunol., 8(1): 93-104.

  • Maori E., Lavi S., Mozes-Koch R., Gantman Y., Peretz Y., Edelbaum O., Tanne E., Sela I. (2007) - Isolation and characterization of Israeli acute paralysis virus, a dicistrovirus affecting honeybees in Israel: evidence for diversity due to intra- and inter-species recombination. J. Gen. Virol., 88: 3428-3438. [Web of Science] [Crossref]

  • Maori E., Paldi N., Shafir S., Kalev H., Tsur E., Glick E., Sela I. (2009) - IAPV, a bee-affecting virus associated with Colony Collapse Disorder can be silenced by dsRNA ingestion. Insect Mol. Biol., 18(1): 55-60. [PubMed] [Crossref] [Web of Science]

  • Nielsen S. L., Nicolaisen M., Kryger P. (2008) - Incidence of acute bee paralysis virus, black queen cell virus, chronic bee paralysis virus, deformed wing virus, Kashmir bee virus and sacbrood virus in honey bees (Apis mellifera) in Denmark. Apidologie, 39(3): 310-314. [Crossref] [Web of Science]

  • Sabath N., Price N., Graur D. (2009) - A potentially novel overlapping gene in the genomes of Israeli acute paralysis virus and its relatives. Virology Journal, 6. [PubMed] [Web of Science]

  • Tentcheva D., Gauthier L., Zappulla N., Dainat B., Cousserans F., Colin M. E., Bergoin M. (2004) - Prevalence and seasonal variations of six bee viruses in Apis mellifera L. and Varroa destructor mite populations in France. Appl. Environ. Microbiol., 70(12): 7185-7191. [PubMed] [Crossref]

  • Thompson J. D., Gibson T. J., Higgins D. G. (2002) - Multiple sequence alignment using ClustalW and ClustalX. Curr Protoc Bioinformatics, Chapter 2: Unit 2.3.

  • Untergasser A., Nijveen H., Rao X., Bisseling T., Geurts R., Leunissen J. A. M. (2007) - Primer3Plus, an enhanced web interface to Primer3. Nucleic Acids Res., 35: W71-W74. [Web of Science]

  • Vanengelsdorp D., Hayes Jr J., Underwood R. M., Pettis J. (2008) - A survey of honey bee colony losses in the US, fall 2007 to spring 2008. PloS one, 3(12): e4071.

  • Vejsnæs F., Nielsen S. L., Kryger P. (2010) - Factors involved in the recent increase in colony losses in Denmark. J. Apic. Res., 49(1): 109-110.

About the article


Published Online: 2012-06-19

Published in Print: 2012-06-01



Citation Information: Journal of Apicultural Science, ISSN (Print) 1643-4439, DOI: https://doi.org/10.2478/v10289-012-0014-x. Export Citation

This content is open access.

Citing Articles

Here you can find all Crossref-listed publications in which this article is cited. If you would like to receive automatic email messages as soon as this article is cited in other publications, simply activate the “Citation Alert” on the top of this page.

[1]
Marina Doris Meixner, Roy Mathew Francis, Anna Gajda, Per Kryger, Sreten Andonov, Aleksandar Uzunov, Grażyna Topolska, Cecilia Costa, Esmaeil Amiri, Stefan Berg, Malgorzata Bienkowska, Maria Bouga, Ralph Büchler, Winfried Dyrba, Kalinka Gurgulova, Fani Hatjina, Evgeniya Ivanova, Mateja Janes, Nikola Kezic, Seppo Korpela, Yves Le Conte, Beata Panasiuk, Hermann Pechhacker, George Tsoktouridis, Giacomo Vaccari, and Jerzy Wilde
Journal of Apicultural Research, 2014, Volume 53, Number 2, Page 215
[2]
Ursula Strauss, Hannelie Human, Laurent Gauthier, Robin M. Crewe, Vincent Dietemann, and Christian W.W. Pirk
Journal of Invertebrate Pathology, 2013, Volume 114, Number 1, Page 45
[3]
F.N. Mumoki, A. Fombong, E. Muli, A.W.T. Muigai, and D. Masiga
African Entomology, 2014, Volume 22, Number 3, Page 473

Comments (0)

Please log in or register to comment.
Log in